Fizyoterapinin hedefleri esas olarak hastanın durumuna göre belirlenir. Temel olarak fizyoterapi, ağrıyı hafifletmek, metabolizmayı ve kan dolaşımını arttırmak, hareketliliği geri kazanmaktır. Ayrıca hareketlilik, koordinasyon, kuvvet ve dayanıklılığı iyileştirmek veya korumak amacıyla fizyoterapi yapılır. Özellikle ortopedide fizyoterapinin araçları omurga ve uzuv hastalıkları ile yaralanma ve ameliyat sonrasında uygulanır. Bunlar arasında kırılmalar, romatizma, skolyoz, bel fıtığı veya doğuştan gelen şekil bozuklukları ve malformasyonlar sayılabilir.